PCR實驗室建設所需資料(liào)
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1周前
4月26日,國家衛健委舉辦全國視頻會議,明確(què)提出“所有縣(xiàn)區級以上疾控機構、二級以上綜合醫院要抓緊進(jìn)行改造,在短時間內形(xíng)成核酸檢測能力”。
各(gè)地的公(gōng)立機構檢測能力不能滿足需求隻是暫時的,獨立醫學實驗室(shì)在(zài)充實檢測力量的同時,發揮自己豐(fēng)富(fù)的檢驗管(guǎn)理(lǐ)運營理念,以及區(qū)域化覆蓋的經驗優勢,融入到“國(guó)家隊”核(hé)酸檢測能(néng)力的建(jiàn)設中,順勢而為,乘勢而(ér)上(shàng)。
隨著各地都(dōu)在建立PCR實驗室(shì),本文(wén)從硬件基礎的角度,梳理了PCR實驗室建設的(de)幾個關鍵點,獨立醫學實驗室可以運用豐富的運營經驗(yàn),進行建設指導、人員梯(tī)隊建立、質控體係搭建、區域化服務支持等。
如何建設PCR實驗室
與PCR實(shí)驗室(shì)建(jiàn)設相關的指導文件主要有四份:
《醫療(liáo)機構管理條例》
《醫療機構臨床實驗室管理辦法》
《臨(lín)床基因擴增檢驗(yàn)實驗室管理暫行辦法》
《醫療機構臨床基因擴增實驗室管理(lǐ)辦法》
要求臨床(chuáng)PCR實(shí)驗室,不但(dàn)在實驗室設置及儀器(qì)設備等硬件上要滿足開展臨床檢驗的條件(jiàn),而且要求實驗室在日常(cháng)工作要有文件(jiàn)化的工作程序。
下麵就(jiù)在PCR實驗室建設過程中的幾個(gè)關(guān)鍵控製點進行闡述:
01
建立PCR實驗室質量管理體係
根(gēn)據實驗室的具體情況編寫質量體(tǐ)係文件,《質量手冊》、《程序文件》、《作業(yè)指導書》,並保證管理體係運行有效。
管理(lǐ)體係的特點是應有明確的目的、規範的管理、有(yǒu)效的(de)製約、高效的機製、能自我(wǒ)發(fā)展(zhǎn)的整體。
建立完善的SOP文件,對完成各項質量活動的方法作出規定(dìng),每個SOP都應對一(yī)個或一組(zǔ)相互關係的活動進行描述。
每個SOP文件應說明該項質量各環節的輸入、轉換和輸出(chū)所需的文件(jiàn)、物(wù)資、人員、記錄以及它們與有關活動的接口關(guān)係。
明確每個環(huán)節轉換過程中各項因素的要求,即由誰做、做什麽、做到什麽程序、達到什麽要求,如何控製(zhì)、形成什麽記錄和(hé)報告,以及相(xiàng)應的審批手續。
規定在質(zhì)量活動中(zhōng)需要注意的例外或特殊情況的糾正(zhèng)措(cuò)施。SOP應簡(jiǎn)練、明確和易懂並且工作人員熟練掌握和嚴(yán)格遵守。
02
PCR實(shí)驗(yàn)室的相關(guān)設置
要(yào)完成一(yī)組PCR實驗,通常需要(yào)經過試劑配製、樣品處理、核(hé)酸擴(kuò)增和產物分析4個實驗過程。
這4個實(shí)驗過(guò)程的實驗用房應相鄰布置,組成一個獨立的(de)PCR實驗區。標準的PCR實驗區包括:試劑準備區、標本製備區、擴增區、產物(wù)分析區、各區配套的緩衝區及公共走廊。
PCR實驗(yàn)室整(zhěng)體平麵布局
某醫院PCR實驗室平麵布局如圖1所示(shì),整個區域有一個公(gōng)用走廊(láng),每(měi)個獨立實驗區設有(yǒu)專門的緩衝(chōng)區。通過壓差控製,使(shǐ)整個PCR實驗過程中試劑和標本免受(shòu)氣溶膠的(de)汙染,並且降低擴增產物對人員和環境(jìng)的汙染。

圖表1、某醫院PCR實驗室平麵圖
試劑準備區
該實驗區主要進行的(de)操作為貯存試劑的製備、試劑的分(fèn)裝和主反應混合液的製備。
試劑和用於標本製作的材料應直接運送至該區,不得經過其他區域。試劑原材料必須貯存(cún)在本(běn)區內,並在本區(qū)內製備成所需的貯存試劑。
試劑準備區配備有2~8°C冰箱和-80°C冰箱,計算冷(lěng)負荷時,需要將它們計算在(zài)內。
房間的(de)麵積宜控製在15m2~20m2。本(běn)區的壓力梯(tī)度要(yào)求為:相對正(zhèng)壓狀態,以防(fáng)止外界含核酸氣溶膠的空氣進入,造成汙染。
標本製備區
該(gāi)區(qū)域主要(yào)進行的操作為臨床標本(běn)的保存、核酸(RNA、DNA)提(tí)取、貯存及其加入至擴增反應管和測定RNA時cDNA的合成。
標本製備區配備有2~8°C冰箱和(hé)-20°C冰箱,計算(suàn)冷負荷(hé)時,需要將它們計算在內。在標本製備(bèi)區,還需要配備生物安全櫃,用於進行提取核酸的操作。
為避免提取的核(hé)酸在(zài)櫃內反複循環,造(zào)成標本之間(jiān)的交叉汙染,出現假陽性結果,該區域配備的生物安全櫃必須是B2型的。生物安全櫃工作區垂直氣流(liú)全部來自實驗室,排風(fēng)經過高效過濾器(www.gdlingjie.net)過濾後直接排至室外(wài),不允許回到安全櫃和實驗室中(zhōng)。
根據經驗,如果實驗室內配備生物安全櫃,每配備一台,實驗室的麵(miàn)積增加(jiā)10m2;標本(běn)製備區的麵積(jī)宜在25m2~30m2之(zhī)間。本區的壓力梯度要(yào)求為:相對於鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區進入本區的氣(qì)溶膠汙染。
擴增室
該區(qū)域主要進行的操作為DNA或cDNA擴增。此外,已製備的(de)DNA模板和合成的cDNA(來自樣本製備區)的加入和主反應混合液(來自試劑貯存和製備區)製(zhì)備成反應混合(hé)液(yè)等也可在本(běn)區內進行。
在巢式PCR測定中,通常(cháng)在第一輪擴增後必須打開反應管,因此(cǐ)巢式擴增有較(jiào)高的汙染危險性,第二(èr)次加樣必須在(zài)本區內進行(háng)。
擴增室主要(yào)配備PCR實驗室的核心儀器PCR儀,本文實例(lì)中使用了ABI7500和ABI9700兩種PCR儀。
在實(shí)驗室建造過(guò)程中,需要給PCR儀配備專門的UPS電源,以保證其正(zhèng)常工作。該區麵積(jī)控製在15m2~20m2。
本區的壓力梯度(dù)要求為:相對於鄰近區域(yù)為負(fù)壓,以避免氣溶膠(jiāo)從本區漏出(chū)。為避(bì)免氣溶膠所致的汙染,應盡量減少在本區內的不必要(yào)的走動。個別操作如(rú)加樣等應在超淨台內進行。建(jiàn)議采用5~10Pa壓(yā)差,在控製上比較容易實現。
產物分析區
該區(qū)域主要進行的操作為(wéi)擴增片段的測定。如使用(yòng)全自動封閉分析儀器(qì)檢測,此(cǐ)區域可不設。
在室(shì)內配(pèi)備通風櫥,保證房間內的相對負壓,空氣(qì)從室(shì)外流向室內。該區麵積控製在15m²~20m²。
本區是最主要的擴增產物汙(wū)染來源,因此對本區的壓力梯度的要求為:相對於鄰近(jìn)區域為負壓,以避免擴增產物從本區擴(kuò)散至其它區域。建議采用5~10Pa壓差,在控製上比較容(róng)易實現。
03
正負壓(yā)區域(yù)緩衝室的設置
根據(jù)壓(yā)力梯度的要求,試劑配製室和樣品處理室為相對正壓,擴增室和產物分析室為相對負壓,要求正(zhèng)壓的區域和要(yào)求負壓(yā)的區(qū)域的緩衝室內的壓力設計大不相同。
正壓緩衝室符合一般正壓潔淨室的緩衝原則,主要是防止室外環境空氣中(zhōng)的氣(qì)溶膠進入室內。正壓緩衝室的布置如圖2所示。

圖表2、正壓緩衝室的布置圖
負壓緩(huǎn)衝室則是要求緩衝室對核(hé)酸擴(kuò)增室及產物分析區保(bǎo)持正壓,對緩衝室外也保持正壓(主要是滿足室內淨化需要,如室內無潔淨要(yào)求(qiú),此處可以為0壓)。負(fù)壓(yā)緩衝室的布(bù)置如圖3所示(shì)。

圖表3、負壓(yā)緩衝室的布置圖
04


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